穆里尼奥在英超联赛中共赢得3次冠军,具体如下：
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2004-2005赛季：穆里尼奥执教切尔西的首个赛季，便带领球队以创纪录的95分夺得英超冠军,同时保持了25场不败的战绩。
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2005-2006赛季：穆里尼奥连续第二个赛季率领切尔西夺得英超冠军,成为英超历史上少数能实现卫冕的主教练之一。
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2016-2017赛季：穆里尼奥在第二次执教切尔西失败后，转而执教曼联，尽管在曼联的执教经历存在争议，但他仍带领球队在2016-2017赛季赢得了英超亚军，并在该赛季的欧联杯中夺冠。真正意义上的英超冠军是他在切尔西时期获得的两次，若将社区盾杯等荣誉排除，仅计算顶级联赛冠军，则穆里尼奥在英超的冠军数量为2次（若将2017年曼联的联赛杯冠军等非顶级联赛冠军纳入统计，则总数会更多，但通常不将其计入英超冠军数量），但根据广泛认可的统计，穆里尼奥在英超共赢得2次顶级联赛冠军，若将问题中的“英超冠军”理解为包括所有正式赛事冠军，则需额外说明其还赢得过其他杯赛冠军，但核心答案聚焦于顶级联赛冠军为2次，而若考虑其执教曼联期间虽未获英超但有其他重要荣誉的背景,最直接且准确的顶级联赛冠军次数回答为：
穆里尼奥在英超联赛中赢得了2次顶级联赛冠军（均来自切尔西时期）。